کاشی کاری های روی گنبد و سقف
اگرچه گنبد این مسجد همانند مسجد امام دو پوسته نیست اما این گنبد نیز با کاشی های رنگارنگ و زیبا پوشیده شده که در زیر نور آفتاب درخشش و جلوه خاصی به آن می بخشد. همچنین برای تزیینات داخلی و خارجی مسجد از بهترین و باکیفیت ترین متریال استفاده شده است. از مشخصه های منحصر به این مسجد می توان به طرح طاووس که در سقف ورودی کار شده اشاره کرد. وقتی دقیقا زیر این سقف بایستید و به آن نگاه کنید، تزیینات سقف طوریست که آن را شبیه به طاووسی که پرهایش را گشوده می کند و این یکدست بودن و توازن که در طراحی این سقف به کار رفته بسیار خاص و شگفت انگیز است.
دیوار های این مسجد بیشتر از کاشی های رنگارنگ و به اصطلاح هفت رنگ و آیه های خطاطی شده پوشیده شده است و به نسبت مسجد شاه کاشی های بیشتری برای مزین کردن آن استفاده شده است.
نورپردازی درونگرا
نورپردازی این مسجد طوری انتخاب شده که ویژگی درونگرا بودن که در ساختارهای ایرانی به چشم میخورد را حفظ کند. نورگیر ها در گنبد ها واقع شده اند تا در طول روز با توجه به تابش نور خورشید نورپردازی متفاوتی را در داخل فضا ایجاد کند.